Lai varētu izmantot autopilota funkcijas, laivas elektromotora kompass ir jākalibrē. Lai iegūtu vislabākos rezultātus, motors ir jākalibrē mierīgā ūdenī dienā, kad nav vēja vai ir neliels vējš. Ja autopilota funkcijas nedarbojas, kā gaidīts, kalibrēšanas procesu varat atkārtot.