Pri použití prekrytia radaru mapový ploter zarovná údaje radaru s údajmi mapy na základe kurzu lode, ktorý je predvolene založený na údajoch magnetického snímača kurzu pripojeného pomocou siete NMEA^® 0183 alebo NMEA 2000^®. Ak snímač kurzu nie je k dispozícii, kurz lode je založený na údajoch sledovania systému GPS.

Údaje sledovania systému GPS ukazujú smer, ktorým sa loď pohybuje, nie smer, ktorým loď ukazuje. Ak sa loď odchyľuje späť alebo do strán v dôsledku prúdov alebo vetra, nemusí byť prekrytie radaru dokonale zarovnané s údajmi mapy. Tejto situácii by sa malo predísť použitím údajom o kurze pohybu lode z elektronického kompasu.

Ak je kurz pohybu lode založený na údajoch z magnetického snímača kurzu alebo automatického pilota, mohli by byť údaje kurzu narušené v dôsledku nesprávneho nastavenia, mechanickej závady, magnetického rušenia alebo iných faktorov. Ak sú údaje kurzu narušené, nemusí byť prekrytie radaru dokonale zarovnané s údajmi mapy.